Mit dem Aufbau des neuen Braunkohlenkraftwerk der VEBA Kraftwerke Ruhr AG (jetzt E-ON) in Schkopau und der Übertragung der schienengebundenen Ver- und Entsorgungsaufgaben des Kraftwerkes an die Buna-Werkbahn ergaben sich neue Aufgabenfelder und eine deutliche Leistungssteigerung. Die zu nutzenden Gleisanlagen des Werkbahnhofs, die Zuführungsgleise zum Kraftwerk und der Kraftwerksbahnhof selbst wurden ab Frühjahr 1993 von Grund auf saniert, modernisiert, erweitert bzw. neu errichtet.